职能科室：

　　附属口腔医院党务办公室（院长办公室）；口腔医学院综合管理办公室；纪检办（审计科）；人事科；科教科（教学办）；医务科；护理部；院感科；财务科（挂号收费室）；后勤保卫科（库房）；信息科；设备科；学工办；团总支（关工委）；创建办公室。

临床科室：

　　牙体牙髓病科；牙周病科；儿童口腔科；口腔粘膜病科；口腔预防保健科；口腔颌面外科；口腔修复科；口腔正畸科；口腔种植中心；口腔急诊科；麻醉科；口腔综合科；特诊科。

医技科室：

　　药剂科；检验科；病理科；放射科；技工中心；消毒供应室；病案室；营养室。

教研室：

　　口腔修复教研室；口腔内科教研室；口腔外科教研室；口腔修复技术教研室；口腔护理及人文教研室。